人的基因都来自父母，比如D3S1358这个位点，每个人有两个位点数据，小孩的两个等位基因（16,17），其中一个必然来自父亲，其中一个必然来自母亲。以D3S1358基因分型为例，孩子有一个16，17，那么父亲或者母亲必然有一个为16或者一个17，如果父亲没有16或者17，就说明这个点位基因分型和孩子不一致，说明不存在遗传关系。其他位点的道理一样，通常有三个及以上位点不符合，那么就可以直接排除他们之间存在父子关系。

基因数据如果只有一个或者两个不符合，有可能出现极低概率的基因突变，那就需要计算亲权指数（CPI）和亲权概率（RCP），如果亲权指数大于10000或者亲权概率大于99.99%，就可以说明他们之间存在生物学亲子关系。

亲子鉴定报告书上有个AML分型，很多人不明白是什么意思，其实那个是性别基因，(X,X)说明性别是女性，（X,Y）说明性别是男性。